中国医学科学院北京协和医学院血液学研究所血液病医院创建于1957年，创办人为著名血液学家、教育家邓家栋教授，其前身是中国人民解放军第十三军医学校（后改变为中国人民解放军259医院），1958年划归卫生部管理，更名为中国医学科学院输血及血液学研究所并设附属医院，1970年迁往四川简阳县组成中国医学科学院分院，1979年回迁天津，1987更名为中国医学科学院中国协和医科大学血液学研究所血液病医院。所院成立50年来，本着“严谨、博精、创新、奉献”的协和精神，成为我国少有的集医疗、科研、教学、产业于一体的科研型血液病专业医疗机构，在血液学及相关领域的研究、血液病防治、新药研制、人才培养等方面取得了许多突出的成就，在国内外享有较高的声誉。
所院占地面积4万平方米，建筑面积4.7万平方米，网络设施先进。拥有一支阵容整齐、结构合理、学术精湛、锐意创新的科研医疗队伍，职工795人，其中专业技术人员676人，正高级职称23人、副高级职称64人；博士生导师10名、硕士生导师22名，有突出贡献专家4人，长江学者特聘教授2人，国家杰出青年基金获得者2人，入选国家百千万人才工程2人，中国医学科学院名医1人，天津市卫生行业“十佳”医务工作者2人。
所院是实验血液学国家重点实验室、国家干细胞工程技术研究中心的依托单位，内科学（血液病）、药物药理学、细胞分子生物学的全国重点学科点，是国家药物临床试验机构，是世界血友病联盟国家成员单位(中国)的执行部门，是卫生部国家核事故医学应急中心临床一部，承办《中华血液学杂志》的编辑、出版和发行工作。
血液病医院是三级甲等专科医院，有病床520张，设有贫血诊疗中心、白血病诊疗中心、干细胞移植中心、淋巴瘤诊疗中心、儿科血液病诊疗中心、MDS诊疗中心、血栓止血诊疗中心、血液病急救中心、综合医疗中心、血液病专家会诊中心和临床检测中心，向国内外患者提供高水平服务和临床科研工作。对常见血液病，特别是恶性血液病的诊断治疗处于国内领先水平。成人急性髓系白血病完全缓解率在80%以上，五年无病生存率达50%以上；急性再生障碍性贫血的5年生存率达70%以上，重型再生障碍性贫血ATG联合免疫治疗的有效率80%。
血液学研究所设有造血干细胞、止血血栓与血管、药理及药物学、细胞分子生物学、免疫与生物治疗和血液肿瘤分子生物学6个学科，主要研究方向为造血组织干细胞生物学及可塑性研究、造血调控及血液血管生成调控分子的基础与应用基础、正常与病理造血细胞和免疫细胞的生长发育，特别是恶性血液病的发病机制等。建立了干细胞库技术平台，干细胞临床移植技术平台，抗体制备技术平台，基因工程药物GMP中试平台，高通量药物筛选技术平台，SPF级实验动物技术平台等共用技术平台。